Храмы
1991
Передача верующим храма Михаила и Фёдора Черниговских
Основная статья: Церковь Михаила и Фёдора Черниговских (Москва)
Открыт клуб "Третий путь" в одной из квартир доходного дома
Основная статья: Третий путь (клуб в Москве)
В доме причта храма Усекновения Главы Иоанна Предтечи под Бором по адресу ул. Пятницкая, д.4, в советское время располагались коммунальные квартиры. В 1991 году в одной из них был открыт первый в Москве культовый клуб «Третий путь», интерьеры которого были выполнены в стиле "подчёркнуто правдивого городского винтажа". Сюда водили иностранцев на экскурсии как в одну из достопримечательностей столицы: обшарпанные стены, много странных людей, залитые пивом столики. В клубе выступали множество известных российских групп, в том числе "Звуки Му", "Вежливый отказ", "Колибри" и другие. Проходили показы художников-модельеров, в том числе Андрея Бартенева. Подробнее здесь.
1994: Роспуск прихода храма Михаила и Фёдора Черниговских из-за конфликтов и учреждение Патриаршего подворья
За 1992 — 94 годы трудами настоятеля и молодого старосты Феодора приходу были возвращены здания богадельни, колокольни и церковного дома. Оформлены два землеотвода по Пятницкой улице с передачей приходу части территории и помещений бывшего доходного домовладения Савинно-Сторожевского монастыря.
Большую помощь в деле борьбы за открытие храмов и оформлении документов на всю церковную собственность оказал Евгений Геннадьевич Третников в то время работавший в Моссовете, а в приходе бывший помощником старосты.Метавселенная ВДНХ 
Постоянные разногласия, разобщенность и нестроения среди членов приходского собрания вынудили отца Сергия с верными ему прихожанами в августе 1994 года обратиться к Святейшему Патриарху с прошением о роспуске прихода и учреждении при храме Патриаршего подворья[1].
Епархиальное начальство в лице Владыки Арсения, Архиепископа Истринского, и протоиерея Бориса Гузнякова, благочинного Москворецкого благочиния приложило немало усилий для примирения сторон и нормализации жизни в приходе, но всё оказалось тщетно. Настоятелем подворья был назначен опытный и уважаемый протоиерей Сергий Карамнов, давний друг отца Сергия Торопцева.
1997: Подворью передано здание Предтеченского храма
В 1997 году было передано здание храма Усекновения главы Иоанна Предтечи под Бором.
Два храма подворья расположены по обе стороны Черниговского переулка.
2006: Даниил Воронин назначен настоятелем подворья
Сергий Карамнов оставался настоятелем храмов Черниговского Переулка до своей смерти в 2006 году. После его преставления в том же году настоятелем обоих храмов был назначен отец Даниил (Воронин). При нём приходская жизнь здесь ещё более оживилась.
2010: Митрополит Иларион назначен настоятелем подворья
1 февраля 2010 года Алфеев Григорий Валериевич (Иларион) возведен в сан митрополита, а 18 августа того же года назначен настоятелем Патриаршего подворья – храмов святых мучеников Михаила и Феодора Черниговских и Усекновения главы Иоанна Предтечи под Бором.
Игорь Разживин, 2013
2022: Митрополит Антоний новый настоятель подворья
7 июня 2022 года на заседании Священного синода РПЦ митрополит Иларион назначен митрополитом Будапештским и Венгерским с освобождением от должности председателя ОВЦС и ректора Общецерковной аспирантуры и докторантуры имени святых равноапостольных Кирилла и Мефодия. В СМИ было отмечено, что в журнале Священного синода (№ 61) ему не была выражена традиционная в таких случаях «благодарность за понесённые труды». 10 июня того же года в Отделе внешних церковных связей передал дела своему преемнику митрополиту Антонию (Севрюку).
15 июня 2022 года указом Патриарха Кирилла освобождён от должностей настоятеля храма иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» на Большой Ордынке г. Москвы и Патриаршего подворья храмов под Бором.
